Обширное литературное произведение, разбитое на несколько частей, представляет собой насыщенный, многослойный рассказ о приключениях на острове, окружённом мраком тайны, и о судьбах его обитателей. В центре сюжета — путешествие на трансатлантическом пароходе «Вениамин Франклин», который в порту Генузы готовится к отплытию, и далее — драматические события, связанные с кораблекрушением, тайнами прошлого и борьбой за выживание.

Первую часть — "На Палу́бe" — характеризует встреча героев у трапа, их реакции на предполагаемый опасный груз и наблюдения за пассажирами. На фоне этого развивается напряжённая атмосфера: встреча молодого человека, излучающего притворную невозмутимость, и грубого спутника, за которым следит преследователь — нью-йоркский сыщик Джим Симпкинс, — который предполагает, что среди путешествующих есть преступник. Введение крупного персонажа — мисс Кингман — дочь миллиардера, добавляет контекст культурной среды, её тревогу и внутренние переживания.

Далее, в описаниях, происходит постепенное развитие сюжета: возникновение морской бури, столкновение с необычного вида морскими существами, следы водососов-гигантов и странные параллели с древностью, создают атмосферу мистики и опасности. Появляются описания трагических заброшенных судов, мертвых кораблей и шпигунские расследования, связанные с преступлениями прошлого, выявляя загадки убитых моряков и потерянных сокровищ.

Во "Второй части" — "Тихая пристань" — усиливается напряжение: корабль входит в затертую воду, заполненную обломками и историческими артефактами. Сплав приключенческих элементов с научно-исследовательскими описаниями, рассказ о затонувших кораблях, легендарных судах Колумба, древних кораблестроительных судьбах, создает уникальное сочетание мистики и научных гипотез. Ведущие персонажи — Гатлинг, Симпкинс, профессор Томсон — устраивают экспедицию по раскрытию тайн морского дна, при этом сталкиваются с опасностями морских чудовищ, водорослевых заторов и загадочной активности мертвого моря — Саргассова.

Ключевой мотив — борьба между добром и злом, вера в прогресс и опасность ностальгии по прошлому, подчёркиваются темы тайны, самоотверженности и самопожертвования. Персонажи преодолевают опасности природных стихий, загадочных существ и человеческих интриг, раскрывая тайны осязаемых и невидимых сил, скрытых под водой и на острове.

В целом, текст объединяет элементы приключенческого романа, научной фантастики и готической мистики, создавая богатый, мультифункциональный мир, насыщенный тайнами, опасностями и внутренними конфликтами героев. Эти сюжеты о поисках, расследованиях и самопознании тесно переплетаются с темой борьбы человека с природой и собственным прошлым, превращая произведение в яркое полотно, полное загадок и интриг.